Edificio construido en sillarejo, de una sola nave con bóveda de cañón. Posee capillas laterales de diferentes cronologías. Conserva ábside románico de planta semicircular, en mal estado de conservación, con ventana abocinada en arco de medio punto dovelado en su centro y otra ventana de diferente factura en el lado sur. En el interior hay una imposta corrida que separa la bóveda de cuarto de esfera del muro. Posee arco triunfal que lo separa de la nave.

La cabecera poseía decoración mural gótica, trasladada actualmente al Museo Diocesano de Jaca.

La mayor parte de las capillas, que se abren a la nave mediante arcos de medio punto, están cubiertas con bóveda de crucería simple.

Posee torre campanario de dos cuerpos adosada al ábside en el lado de la epístola. Dos contrafuertes soportan el primer cuerpo en su lado sur. El segundo presenta dos vanos alargados en arco de medio punto también en el lado sur. El tejado es de tejas planas a dos vertientes.

La iglesia está precedida por un pórtico que se abría al exterior a través de un arco de medio punto, cuyas dovelas y jambas fueron robadas a finales de 2019.

Bajo el pórtico había un escudo del monasterio de San Juan de la Peña.

Fue, a su vez, lugar de enterramientos en el coro, la nace, las capillas y el pórtico. El cementerio general estaba adosado al exterior de su ábside.

A la izquierda de su fachada se adosaba la Abadía con una característica entrada.