El conjunto colegial se levanta sobre una pequeña elevación al norte del primitivo núcleo defensivo. Próximos a ella se emplazan los edificios más representativos de la ciudad, la lonja y el ayuntamiento.

Se trata de una construcción barroca edificada sobre los cimientos de otra anterior, correspondiente a los siglos XIII y XIV. La primitiva iglesia gótica constaba de tres naves de cinco tramos y ábside poligonal con tres capillas. De ella sólo se conserva la torre adosada al flanco occidental.
A finales del siglo XVII se sustituyó la capilla norte adosada a la cabecera por la monumental capilla de la Soledad. En 1735 se comenzó la demolición de la iglesia descrita, conservándose sólo la torre y la citada capilla, para sustituirla por una nueva construcción, terminada en 1757, diseñada por Domingo Yarza, que cambia la orientación primitiva para seguir ahora un eje en dirección noreste-sureste.

Consta de tres naves, de seis tramos cada una, con capillas entre los contrafuertes, crucero no marcado en planta y testero recto formado por tres capillas de dos tramos, siguiendo claramente el modelo marcado por la basílica del Pilar de Zaragoza. En el tercer tramo desde los pies, abierta a la nave de la Epístola se encuentra la capilla de la Soledad.

La nave central y los brazos del crucero se cubren con bóvedas de lunetos, las naves laterales con arista, las capillas con cupulines elípticos; en la cabecera se utiliza para los tramos mayores cúpula semiesférica sobre pechinas y para los tramos pequeños bóveda de lunetos; por último, en el tramo central del crucero se recurre de nuevo a la cúpula semiesférica sobre pechinas y cimborrio, abierta al exterior con linterna.
Toda la cubrición apea en pilares cruciformes, que constan de basa, fuste, capitel con decoración de hojas de acanto, entablamento completo y banquillo que peralta los arcos.
Los muros interiores están enlucidos en tonos claros siguiendo los parámetros clasicistas marcados por la basílica del Pilar de Zaragoza. La cúpula del crucero se decoró con pinturas murales al fresco, que desarrollan escenas de la vida de la Virgen. Destacan los relieves en estuco que decoran los ventanales, las pechinas del crucero y las tres capillas de la cabecera.

El exterior queda determinado por la monumentalidad de los volúmenes: sobre el potente cuerpo de naves sobresalen el cimborrio del crucero, la torre gótica y la fachada principal a los pies.

La fachada principal es de una gran monumentalidad tanto por sus dimensiones como por su disposición. Aparece dividida en cinco calles, de las cuales las dos laterales se rematan con torres y las tres centrales con un cierre mixtilíneo. La calle central alberga bajo un gran arco de medio punto la portada escultórica barroca, compuesta de dos cuerpos y ático, y decorada profusamente con relieves abultados.
El acceso, en el primer cuerpo, está flanqueado por dos pares de columnas, entre las que se disponen en hornacinas las estatuas de los santos Pedro y Pablo. Cierra con entablamento quebrado por una curva central. El segundo cuerpo enmarca entre columnas salomónicas la imagen de la Virgen con el Niño, flanqueada por las imágenes de los santos Santiago y Pancracio; en ambos extremos se disponen las de los arcángeles Miguel y Gabriel. El ático consiste en un gran ventanal con las esculturas de san Ramón Nonato y san Pedro Mártir a los lados.