Está situada en la sierra de Caballera, en el comienzo del barranco de Santa Quiteria o San Cristóbal, que en este punto forma un estrecho cañón. La ermita se enclava a media altura de una pared rocosa, en el interior de una cavidad de la misma, en cuyos alrededores se abren otras pequeñas cavidades que fueron tapiadas para utilizarse como celdas de ermitaños. En toda esta zona del barranco hay otras celdas abiertas en las paredes, en lugares inaccesibles.

La ermita se sitúa en una cavidad de la pared de roca cerrada por un largo muro de mampostería. Dicha cavidad está dividida en varios tramos, en el central de los cuales se sitúa la ermita, con celdas a derecha e izquierda. Es rectangular, con una celda a modo de sacristía adosada a la cabecera prolongándola. Originalmente debía de tener unos 8 metros de longitud, con la puerta de ingreso en la pared del río y un altar frente a ella.

En un momento indeterminado debió de hundirse parte del muro lateral, que aparece parcialmente reparado con mampostería de color tostado. En esta ocasión se tapió la antigua puerta y se instaló allí un altar bajo arco de medio punto rebajado. Probablemente también en ese momento se realizaron pinturas de carácter popular en su interior: cruz, estrellas y motivos geométricos frente al primitivo altar y estrellas y motivos lineales en el arco de la antigua puerta. Las pinturas se extienden asimismo a la sacristía, profusamente decorada: arco pintado rematado por cúpula con cruz, motivos vegetales y figuras geométricas. Los muros de la ermita están además casi totalmente recubiertos de firmas y grafitos, datados en su mayoría en los siglos XVIII y XIX, aunque hay alguno anterior.

En el siglo XVIII se alargó la nave por uno de sus lados cortos y se instaló un coro alto en esa zona, donde se abrió la nueva puerta de acceso. Esto obligó a cambiar de nuevo la ubicación del altar, que se instaló en el muro situado frente a la nueva puerta, siendo tapiado el construido con anterioridad.