Si bien la Estación de Riegos fue construida originalmente entre 1906 y 1910, el conjunto arquitectónico existente en la actualidad es producto de una profunda remodelación integral y reconstrucción llevadas a cabo en 1933 por la Confederación Hidrográfica del Ebro, que pasó en ese momento a gestionar la estación.
El conjunto primitivo constaba de tres edificios dispuestos en forma de U. El que estaba situado en la parte central constaba de dos plantas, mientras que los laterales tenían una sola. Se caracterizaban por una equilibrada y regular distribución de vanos adintelados en sus fachadas, rodeados por molduras ornamentales, y muy especialmente por disponer en sus extremos de llamativos hastiales escalonados.
La reforma de 1933 supuso una reconstrucción casi total del conjunto que debió conllevar la demolición de gran parte de los edificios preexistentes (aunque, al parecer, puede conservarse una pequeña parte de la obra antigua en las nuevas construcciones), si bien se mantuvo la disposición general de las instalaciones. Tanto la concepción y distribución de la obra nueva como las soluciones formales adoptadas recuerdan enormemente al Centro Agronómico de Almudévar, diseñado por el arquitecto Regino Borobio para la Confederación Hidrográfica del Ebro en 1927, lo cual ha llevado a la investigadora Silvia Isabal a suponer que Borobio pudo ser también el autor de la remodelación del conjunto de Binéfar.
De este modo se reedificaron los tres pabellones preexistentes, si bien se mantuvo su distribución en forma de U. En el edificio central, que fue prolongado por sus extremos, se situaron las oficianas y despachos para el ingeniero y el personal, un laboratorio y las viviendas del ingeniero y el guarda. Uno de los pabellones fue destinado a taller y garaje y el segundo a cuadras y almacenes. Asimismo la CHE construyó otras estructuras auxiliares, como un invernadero, depósito de agua, transformador, etc., y mejoró el sistema de acequias y caminos existentes.
Desde el punto de vista formal. El conjunto de los edificios principales se caracteriza por la destacada presencia de arquerías de medio punto enmarcadas por vanos adintelados de formato apaisado dispuestos con gran regularidad y un acusado sentido rítmico, que guardan una importante similitud visual con los diseños efectuados por Borobio para el centro de Almudévar.
Así, el pabellón principal consta de tres cuerpos, el central de los cuales está ligeramente adelantado para disponer un porche abierto mediante tres grandes arcos de medio punto, sobre los que se disponen en eje grandes ventanas apaisadas. Los pabellones laterales cuentan con dos grandes puertas gemelas en arco de medio punto en su parte central flanqueadas por una sucesión de vanos adintelados. Las fachadas traseras de los tres edificios carecen de arquerías, pero también presentan una composición muy cuidada a base de vanos de dimensiones similares a los de las fachadas principales, dispuestos con una gran regularidad y simetría.
Las restantes estructuras auxiliares mencionadas (invernadero, depósito de agua, etc.) se encuentran en la zona trasera del conjunto.
En la actualidad el edificio principal se encuentra en mal estado de conservación.